сервак как сервак:
CPU: Intel(R) Xeon(R) CPU 3040 @ 1.86GHz (1866.74-MHz 686-class CPU)
Origin = "GenuineIntel" Id = 0x6f2 Stepping = 2
Features=0xbfebfbff<FPU,VME,DE,PSE,TSC,MSR,PAE,MCE,CX8,APIC,SEP,MTRR,PGE,MCA,CMOV,PAT,PSE36,CLFLUSH,DTS,ACPI,MMX,FXSR,SSE,SSE2,SS,HTT,TM,PBE>
Features2=0xe3bd<SSE3,RSVD2,MON,DS_CPL,VMX,EST,TM2,SSSE3,CX16,xTPR,PDCM>
AMD Features=0x20100000<NX,LM>
AMD Features2=0x1<LAHF>
Cores per package: 2


юзеров - человек 50, все кодеки g711 (перекодирования нет)
одновременных разговоров - до десяти

Так бы сразу и сказали. Я во фре не специалист.

вот почему-от я подозревал, что именно этим все закончится

Нет, могло закончится и этим: "Снесите фрю, ставьте Linux" :-)

ну... между прочим, пуркуа бы, собссно.
только сомнительно мне, что поможет.

в другом месте стоит новый альтлинукс и ситуация с таймингом ненамного лучше. все-равно один семпл теряется

Думаю проблема в echo canceller'е каком нибудь включенном. Поставьте для E1 в /etc/asterisk/zapata.conf:
echocancel=no
echocancelwhenbridged=no
echotraining=no
callprogress=no

ну... эхо кенселлер если даже и включен, то отключется по тонам.
выключал - не помогает

А куда у тебя E1 воткнут? И что внутри E1 идет? ISDN?

куда-куда. в *. на том конце телефонный оператор, вестимо.

вот рабочие конфиги


заптел:
loadzone=us
defaultzone=us

#Sangoma A101 port 1 [slot:10 bus:1 span:1] <wanpipe1>
span=1,1,0,ccs,hdb3
bchan=1-15,17-31
dchan=16


запата
[trunkgroups]
[channels]
context=default
usecallerid=yes
hidecallerid=no
callwaiting=yes
usecallingpres=yes
callwaitingcallerid=yes
threewaycalling=yes
transfer=yes
canpark=yes
cancallforward=yes
callreturn=yes
relaxdtmf=yes
rxgain=0.0
txgain=0.0
group=1
callgroup=1
pickupgroup=1
immediate=no
; это выключал, не помогает
echocancel=yes
echocancelwhenbridged=no
echotraining=no
callprogress=no



;Sangoma A101 port 1 [slot:10 bus:1 span:1] <wanpipe1>
switchtype=euroisdn
context=default
group=1
signalling=pri_cpe
pridialplan=local
prilocaldialplan=national
channel =>1-15
channel =>17-31

Значит дело всетаки в прерываниях. Попробуй выключи все ненужные PCI девайсы в БИОСе: audio, usb, com и тд. (список девайсов можно посмотреть lspci -v)
Также желательно если используется IDE HDD установить максимальный Ultra DMA режим работы (например у меня hdparm -i /etc/hda показывает udma4).
Также для карты лучше отвести отдельное IRQ в биосе если есть возможность и не шарить его с другими.

ЗЫ: Делал это для Digium TE405P - помогло. Стало 100% выдавать на zttest до 10 раз подряд.