Есть ли между ними заметная разница?
Больше всего интересует удобство создания ivr-меню и возможности работы с факсами.

В обоих продуктах используется один и тот же менеджмент - freePBX.
Поэтому нет никакой разницы в удобстве создания ivr-меню. Если попрактиковаться в сборках, можно создать свой дистрибутив, в который включить freePBX.
Работа с факсами - слишком широкое понятие.

По факсу - нужен стандартный прием и отправка на мыло.

Это уже ТЗ?
Непонятно, понятно Вам объяснение или непонятно.
Вроде не совсем, если породило такую установку. Вопрос был про менеджмент (удобство), а вдруг переместился к механизму.
Всё равно что обсуждать накладные панели на моб. телефон, забывая про сам телефон.
- Есть кнопка принять и отправить?
- Есть.
- Есть возможность выбора мелодии?
- Есть такая кнопка (в телефоне такой возможности может и не быть).

да, вопрос свелся к механизму (это же форум не только продавцов но еще и тех.специалистов)
Меня интересует, имеется ли в этих сборках возможность принять на какой-либо экстеншн звонок от факс-аппарата, получить факсовое сообщение и переслать его на емейл (в виде tiff или pdf или еще как)

На данный момент, на сколько я знаю, в AsteriskNOW астер собран без SpanDSP и сходу прием в файл работать не будет.

В триксбоксе для ветки 1.4 собран и сходу будет работать.

будет или должен? ;)