Можно ли в триксбоксе сделать так, что если у входящего абонента определился номер, то он бы соединялся с соответствующим телефоном?

я так понимаю это надо делать входящий маршрут?

Нет такого понятия в современной VoIP телефонии - АОН.

хорошо. забуду это ужасное слово.
а все таки что есть CID и DID?
я так понимаю в одно из них и несет информацию о номере звонящего

http://ru.wikipedia.org/wiki/DID
http://ru.wikipedia.org/wiki/АОН

во. значит КИД. а шаблоны для CID там есть?

- A ?

даже нет. фиг с шаблонами.
как трикс хранит свои настройки?
хотелось бы програмно добавлять к нему входящие маршруты

Как хранит? вроде нормально, настройки не портятся от срока хранения.
- Что програмно? Входящие куда?

а в каких файлах он их хранит?

Да во всяких!
В основном - в текстовых.